Aono Tsukune nie radzi sobie za dobrze w szkole. Okropne wyniki nauczania uniemożliwiły mu znalezienie jakiejkolwiek szkoły średniej, która by go przyjęła. W ostatniej chwili jego ojciec załatwia mu przyjęcia do Szkoły Średniej Youkai, nie zdając sobie sprawy, jaki los szykuje swojemu synowi. Pierwszego dnia udaje na rozpoczęcie roku do nowej placówki specjalnym autobusem. Na miejscu szybko orientuje się, że szkoła ta różni się mocno od innych miejsc nauczania.
Rok 2022. W technologii wirtualnej rzeczywistości nastąpił przełom. Inżynierom udało się stworzyć hełm nazwany NerveGear - narzędzie zdolne przenieść świadomość użytkownika do świata gier. Tytułem startowym na tę platformę został Sword Art Online (SAO). Yuuki Asuna przez przypadek znajduje ten zestaw wraz z grą w pokoju swojego starszego brata. 
Morishima Hodaka w wieku szesnastu lat ucieka z rodzinnej miejscowości do Tokio. Na miejscu zaczyna poszukiwania pracy, jednak po pewnym czasie uświadamia sobie, iż w jego sytuacji nie ma szans na znalezienie niczego legalnego. Wykończony i głodny wchodzi do pobliskiego baru szybkiej obsługi, gdzie młoda, życzliwa sprzedawczyni funduje mu posiłek. Hodaka przypomina sobie o wizytówce otrzymanej od mężczyzny poznanego na statku podczas rejsu do Tokio i postanawia się z nim skontaktować.
Dwie siostry od najmłodszych lat doświadczają obecności istot ze świata duchowego. Starsza - Shizuru je dostrzega, natomiast młodsza - Mizuki potrafi się z nimi komunikować. Po serii problemów w szkole ich rodzice w akcie bezsilności postanawiają oddać je pod opiekę dziadków mieszkających na wsi ze względu na ich wiedzę na temat radzenia sobie z różnymi youkai.
Mina Țepeș - córka Vlada Țepeș i jednocześnie obecna królowa wampirów ujawnia egzystencje jej rasy w pewnym programie telewizyjnym prowadzonym na żywo. Oznajmia również, iż ma w planach zbudowania w Japonii sanktuarium zwanego Vampire Bund, które ma funkcjonować na zasadach autonomicznego państwa wampirów. Mina używa także pieniędzy z rodzinnego skarbca zgromadzonych przez wieki by spłacić dług narodowy Japonii i przez to wymusić zgodę na władzy.
Rok 2022. W technologii wirtualnej rzeczywistości nastąpił przełom. Inżynierom udało się stworzyć hełm nazwany NerveGear - narzędzie zdolne przenieść świadomość użytkownika do świata gier. Tytułem startowym na tę platformę został Sword Art Online (SAO). Kirigaya Kazuto znalazł się w szczęśliwej grupie ludzi, którzy mogli jako pierwsi wypróbować nowy produkt. Z niecierpliwością oczekiwał dnia premiery, by w końcu przenieść się do Aincard.
Morioka Kouhei pragnie zostać fotografem. Niestety na każdym zdjęciu wykonanym przez niego uchwycone są istoty nie z tego świata. Chłopak wykorzystuje ten fakt pracując dla magazynu zajmującego się sprawami paranormalnymi. Pewnego razu podczas wyjazdu do Niemiec spotyka w zamku tajemniczą dziewczynę o imieniu Hazuki przetrzymywaną tam wbrew jej woli. Kouhei postanawia ją uratować co doprowadza do konfliktu z jej opiekunem.
Nadchodzi czas kolejnej wojny o Świętego Grala. Rodzina Einzbernów decyduje się na zatrudnienie zabójcy magów zwanego Emiyą Kiritsugu by walczył pod ich sztandardem. W ramach przypieczętowania umowy ma on zawrzeć związek małżeński z ich jedyną córką Irisviel. Kiritsugu ma swe powody by wziąć udział w tej wojnie, bez zastanowienia przyjmuje złożoną mu propozycję i przystępuje do działania przyzywając bohatera z zaświatów, będącym jego sługą - Saber.
Wielki pożar w mieście Fuyuki powoduje śmierć niewyobrażalnej ilości osób. Shirou, jako nieliczny z ocalałych zostaje uratowany i zaadoptowany przez człowieka zwanego Emiya Kiritsugu, który następnie wpaja mu podstawy magii. Pewnej nocy po śmierci swojego przybranego ojca Shirou w drodze powrotnej ze szkoły jest światkiem walki między nadnaturalnie silnymi wojownikami.
Za oknem pochmurno, coraz szybciej słońce zachodzi - wszystko wskazuje na to, iż zbliża się jesień, pora więc na kolejną polecajkę.