Pewnej nocy Byleth i Jeralt ratują trójkę młodych książąt - Edelgard, Dimitri oraz Claude z rąk bandytów. Są oni pod wielkim ważeniem ich wyczynu i postanawiają zaprosić wybawców do Monastyru Garreg Mach będącego jednocześnie domem Kościoła Seiros - dominującej religii regionu Fódlan. Byleth szybko dostaje propozycję etatu profesora na miejscowej uczelni - w tym celu zobowiązany jest wybrać jeden z trzech wiodących domów - Black Eagles, Blue Lions lub Golden Deer i poprowadzić uczniów do niego przynależących jako ich opiekun.