Azusagawa Sakuta od czasu poznania Sakurajimy Mai nieustannie doświadcza nadprzyrodzonych zjawisk zwanych syndromem dorastania. Po przeżyciach z Mai, która w niewyjaśniony sposób przestała być zauważana przez innych ludzi oraz jego siostrą Kaede nadszedł czas na ostateczne rozwiązanie sprawy podwójnej egzystencji Makinohary Shouko.
Wakacje prawie dobiegają końca. Uczniowie z wioski Asahigaoka powoli przygotowują się na powrót do szkoły. Nieoczekiwanie jednak, Suguru wygrywa w loterii supermarketu sąsiedniego miasta trzydniową wycieczkę do Okinawy dla kilku osób. Renge, Komari, Hotaru, Natsumi, Hikage oraz Suguru zapraszają na wyjazd swoją nauczycielkę Kazuho i właścicielkę sklepu ze słodyczami - Kaede.
Kase Tomoka to popularna uczennica szkoły średniej, aktywnie udzielająca się w klubie lekkiej atletyki decyduje się wyznać swoje uczucia nieśmiałej dziewczynie - Yamadzie Yui, którą codziennie widuje na szkolnym dziedzińcu.
W podziemnym świecie, gdzie wszędzie rozciągają się tunele wypełnione mrokiem żyją ludzie. Patema, księżniczka podziemnej osady uwielbia zwiedzać te tunele. Jej ulubionym miejscem jest zakazana strefa, do której rada starszych wioski zabrania mieszkańcom się zbliżać.